納豆のネバネバには「ナットウキナーゼ」という酵素が含まれます。この酵素は血管内にできる血栓を溶かす働きがあり、食べてから約10～12時間、その作用が続くといわれています。一方、脳梗塞を引き起こす原因にもなる血栓は、睡眠中の脱水も加わり、深夜から早朝にかけてできやすいといわれています。そのため納豆はナットウキナーゼが体内で有効に働く時間帯から逆算して、夕食時に食べるのがお勧めです。

栄養豊富な大豆の成分解剖
http://www.otsuka.co.jp/company/business/soylution/encyclopedia/ingredient.html